空間組測(cè)序技術(shù)，作為現(xiàn)階段單細(xì)胞技術(shù)的重要補(bǔ)充技術(shù)進(jìn)入了組學(xué)的實(shí)驗(yàn)領(lǐng)域以及生物信息學(xué)的分析領(lǐng)域。通過(guò)單細(xì)胞測(cè)序（單細(xì)胞表達(dá)尺度）+空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序（空間表達(dá)尺度）+數(shù)字病理（臨床診斷尺度）聯(lián)合分析可在空間和時(shí)間上描述不斷演變的組織生態(tài)系統(tǒng)，多角度深入分析組織的形態(tài)特征、基因組學(xué)特征、表觀遺傳調(diào)控因子以及樣本中的免疫微環(huán)境。不同于單細(xì)胞測(cè)序分析的需求-分析-需求-分析的模式，空間轉(zhuǎn)錄組分析實(shí)際上是非常需要研究者和企業(yè)之間的互動(dòng)的，尤其是對(duì)于組織切片的理解，一個(gè)在線互相交流空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果的系統(tǒng)也是空轉(zhuǎn)分析中不可或缺的一環(huán)，也是重中之重。國(guó)產(chǎn)化PanoCell空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序平臺(tái)，提供高性?xún)r(jià)比服務(wù)方案。西安烈冰空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析 10XVisium的實(shí)驗(yàn)主要分為兩部分：組織學(xué)板塊和組學(xué)板塊。組織學(xué)板塊包括樣品的包埋、切片、固定、染色及成像，記錄切片的形態(tài)學(xué)信息；組學(xué)板塊包括cDNA的合成、擴(kuò)增、接頭連接和測(cè)序，記錄切片的轉(zhuǎn)錄本信息和空間位置信息。具體實(shí)驗(yàn)流程如下：A、切片制備和優(yōu)化：取新鮮組織、冷凍、切片，并進(jìn)行HE染色成像，優(yōu)化確定切片是否覆蓋靶向區(qū)域。B、切片固定和透化：將組織切片放置在含有與RNA結(jié)合捕獲探針的載玻片上，并進(jìn)行固定和透化，使細(xì)胞中的mRNA得到釋放，并結(jié)合到相應(yīng)的捕獲探針上，從而獲取基因表達(dá)信息。C、逆轉(zhuǎn)和文庫(kù)構(gòu)建：以捕獲的RNA為模板，進(jìn)行cDNA合成，和測(cè)序文庫(kù)制備。D、高通量上機(jī)測(cè)序：對(duì)制備好的測(cè)序文庫(kù)，進(jìn)行二代高通量短讀長(zhǎng)測(cè)序。E、數(shù)據(jù)可視化分析：結(jié)合HE結(jié)果，確定哪些基因有表達(dá)，表達(dá)量高低，以及這些基因的空間位置信息北京高通量測(cè)序空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務(wù)烈冰測(cè)序數(shù)據(jù)分析平臺(tái)，不依賴(lài)已有物種信息，可研究非模式物種，針對(duì)不同平臺(tái)的數(shù)據(jù)，制定多套流程； 基于橋式PCR技術(shù)的簇生成可以將模版鏈迅速擴(kuò)增成千上萬(wàn)倍，保證過(guò)程中足夠的測(cè)序深度。測(cè)序時(shí)使用特殊標(biāo)記的dNTP：1）堿基上通過(guò)敏感鍵修飾上不同的熒光基團(tuán)，用于區(qū)分ATCG；2）3端使用疊氮基團(tuán)封閉，保證一次循環(huán)只上一個(gè)dNTP。每一輪循環(huán)結(jié)束時(shí)，會(huì)通過(guò)高速熒光顯微鏡記錄熒光圖像，再通入試劑除去熒光基團(tuán)和疊氮基團(tuán)，開(kāi)啟下一循環(huán)。通過(guò)分析讀取同一位點(diǎn)的熒光，實(shí)時(shí)獲取模版鏈的堿基序列。由于過(guò)程中使用的化學(xué)反應(yīng)并不可控，隨著循環(huán)數(shù)的增大會(huì)出現(xiàn)不同步的情況，因此Illumina的讀長(zhǎng)只能限制在200bp左右。 空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的數(shù)據(jù)質(zhì)量和玻片有效區(qū)域的利用率、貼片的質(zhì)量和透化時(shí)間息息相關(guān)。貼片質(zhì)量不良會(huì)影響總的有效spot數(shù)等；而透化不合理會(huì)導(dǎo)致spot的reads數(shù)、基因中位數(shù)等參數(shù)。而在特異性基因表達(dá)方面，我們也可以統(tǒng)計(jì)空間轉(zhuǎn)錄組群體的特異性基因表達(dá)即Markergene，將他們?cè)诮M織切片以及空轉(zhuǎn)上進(jìn)行著色。我們也可以對(duì)于任意一個(gè)已知的基因或者數(shù)據(jù)庫(kù)中的一些細(xì)胞Marker，然后將其在基因表達(dá)在空間轉(zhuǎn)錄組的切片以及HE染色上展示自己的基因表達(dá)進(jìn)而了解，群體中的可能的細(xì)胞組成關(guān)系?？臻g轉(zhuǎn)錄組可展示組織切片中不同區(qū)域的基因表達(dá)情況，揭示精細(xì)病理區(qū)域的信號(hào)通路。 10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)通過(guò)將組織切片的高通量mRNA分析和形態(tài)學(xué)背景整合，使基因表達(dá)譜可以被定位回它們的原始空間位置。傳統(tǒng)的空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)局限于冰凍組織切片。10x Genomics推出全新的針對(duì)FFPE樣本的Visium空間基因表達(dá)解決方案，該技術(shù)打破從FFPE組織樣本中獲取空間全部轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)信息的壁壘，能夠從FFPE樣本中獲取高靈敏度、高特異性的相關(guān)基因的表達(dá)信息，在形態(tài)學(xué)背景下實(shí)現(xiàn)真正的探索發(fā)現(xiàn)，進(jìn)一步擴(kuò)展空間生物學(xué)的可能性。烈冰生物成立于2010年，專(zhuān)注于空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序領(lǐng)域科研服務(wù)。青島scRNA空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序服務(wù)公司 烈冰生物全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序通過(guò)雙文庫(kù)構(gòu)建，實(shí)現(xiàn)多種RNA的一網(wǎng)打盡。西安烈冰空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析 RNA測(cè)序（RNA-seq）是轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的重要工具，也是生命科學(xué)領(lǐng)域常用的技術(shù)之一。相比于傳統(tǒng)通路研究低維度、低通量的局限性，轉(zhuǎn)錄組學(xué)有以下優(yōu)勢(shì)：1）能夠動(dòng)態(tài)考察細(xì)胞基因組的表達(dá)，多維度地反映差異變化；2）可用于研究占RNA絕大部分的非編碼RNA，研究其結(jié)構(gòu)以及在細(xì)胞生命活動(dòng)中的重要調(diào)控作用；3）與蛋白組學(xué)研究相互補(bǔ)充，多角度呈現(xiàn)細(xì)胞水平的變化信息。作為轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的技術(shù)基礎(chǔ)，RNA測(cè)序技術(shù)也在不斷地更新迭代，現(xiàn)如今更大通量、更深精度的測(cè)序?yàn)楸姸嗫蒲泻歪t(yī)學(xué)工作者提供了豐富的工具和探索真理的手段。西安烈冰空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析 上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司辦公設(shè)施齊全，辦公環(huán)境優(yōu)越，為員工打造良好的辦公環(huán)境。致力于創(chuàng)造***的產(chǎn)品與服務(wù)，以誠(chéng)信、敬業(yè)、進(jìn)取為宗旨，以建NovelBio,烈冰生物,NovelBrain,PanoCell,烈冰智造產(chǎn)品為目標(biāo)，努力打造成為同行業(yè)中具有影響力的企業(yè)。公司不僅*提供專(zhuān)業(yè)的生物科技、醫(yī)藥科技、信息科技、計(jì)算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開(kāi)發(fā)、技術(shù)服務(wù)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢(xún)，市場(chǎng)營(yíng)銷(xiāo)策劃，市場(chǎng)信息咨詢(xún)與調(diào)查（不得從事社會(huì)調(diào)查、社會(huì)調(diào)研、民意調(diào)查、民意測(cè)驗(yàn)），從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù)，計(jì)算機(jī)、軟件及耗材（除專(zhuān)控），軟件開(kāi)發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目，經(jīng)相關(guān)部門(mén)批準(zhǔn)后方可開(kāi)展經(jīng)營(yíng)活動(dòng)】，同時(shí)還建立了完善的售后服務(wù)體系，為客戶(hù)提供良好的產(chǎn)品和服務(wù)。自公司成立以來(lái)，一直秉承“以質(zhì)量求生存，以信譽(yù)求發(fā)展”的經(jīng)營(yíng)理念，始終堅(jiān)持以客戶(hù)的需求和滿(mǎn)意為重點(diǎn)，為客戶(hù)提供良好的單細(xì)胞測(cè)序，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái)，空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序，從而使公司不斷發(fā)展壯大。